ماجرای جانشینی پیامبر اسلام(ص) تنها به واقعه سقیفه محدود نمی‌شود؛ بررسی جایگاه حضرت فاطمه زهرا(س)، ماجرای فدک و قوانین ارث در قرآن، ابعاد دیگری از تحولات سیاسی و حقوقی پس از رحلت پیامبر را آشکار می‌کند. مستند «جانشین» با تکیه بر پژوهش‌های ویلفرد مادلونگ، اسلام‌شناس برجسته آلمانی، روایتی متفاوت از این مقطع مهم تاریخ اسلام ارائه می‌دهد.