Pemerintah Kota Malang menjalin kemitraan dengan berbagai perguruan tinggi, di antaranya Universitas Brawijaya, Universitas Negeri Malang, Politeknik Negeri Malang, Universitas Muhammadiyah Malang, Universitas Merdeka Malang, Institut Teknologi Nasional Malang, Universitas PGRI Kanjuruhan Malang, Universitas Tribhuwana Tunggadewi, hingga berbagai sekolah tinggi kesehatan dan administrasi.