روده سالم بستگی زیادی به ترکیب و تنوع باکتری‌های مفید آن دارد. متخصصان تاکید دارند که صِرف خوردن «میکروب‌های خوب» (در قالب مواد غذایی که حاوی این میکروب‌ها هستند) کافی نیست بلکه باید این باکتری‌ها را وقتی داخل روده هستند با ترکیبات مناسب، تغذیه کرد (تغذیه میکروبیوم روده).