सिस्टर बाजार की स्थापना के बारे में अलग-अलग धारणाएं हैं. स्थानीय लोककथाओं के मुताबिक, इस बाजार का नाम और इसकी स्थापना मसूरी में स्थित कॉन्वेंट स्कूलों की नन (सिस्टर्स) से जुड़ी हुई मानी जाती है लेकिन क़ई लोग मसूरी को बसाने वाले कैप्टन यंग को इसका श्रेय देते हैं.